全基因组范围的可变聚腺苷酸化（APA）位点变化是植物应对多种胁迫的基因调控的重要策略，但是对于木本多年生植物中的相关研究比较欠缺。

基于此，中国林科院亚林所景观植物育种与培育研究团队以毛果杨（Populus trichocarpa）为对象，通过对其幼苗高温和低温处理下的全基因组的polyA位点进行系统研究，鉴定出了25919个polyA位点簇，其中高温和低温胁迫下分别有3429和3139个基因的polyA位点发生了变化。研究发现，具有APA的一小部分基因的开放性阅读框受到影响，且与RNA代谢相关的通路在热胁迫和冷胁迫下都与调节APA有关。与冷胁迫和对照相比，热胁迫诱导的反义PACs明显更多。此外，研究还发现一个独特的顺式元件(AAAAAA)主要富集于毛果杨基因PACs的下游，而这一序列只在热胁迫条件的PACs中缺失，表明其具有独特的热胁迫抵抗机制。研究表明polyA尾巴的频繁变化可能是胁迫应答的潜在基因调控机制，而且与其独特序列特征有关。相关成果发表在国际学术期刊《BMC Genomics》（《BMC基因组学》），本研究为树木的多聚腺苷酸化模式响应温度胁迫的研究提供参考。

本研究得到中国林科院林木遗传育种国家重点实验室自立专项（CAFYBB2018ZY001-1）的资助。中国林科院亚林所博士研究生晏巢为论文第一作者，殷恒福副研究员为通讯作者。（晏巢、殷恒福）

论文链接：https://doi.org/10.1186/s12864-020-07353-9

杨树研究进展